復合微生物菌肥是以有機質為基礎，與菌劑和無機肥混合而成。能在減少環(huán)境污染的前提下，增強土壤活性和肥料效率，提高作物產量和品質，促進現代生態(tài)農業(yè)的發(fā)展，為了提高生物肥料的利用率，應考慮以下八個方面。

1、了解生物肥料的基本信息，如生產日期，保質期，用途，使用方法等。非立即使用的，應按說明書存放，注意避光、通風、干燥。

2、了解生物肥料的適宜作物等中的主要作用，例如根瘤菌肥料適用于豆類作物作結瘤固氮的接種劑；磷細菌肥料可將不溶性磷轉化為有效磷和無機磷。

3、掌握應用時間和技術，可以用“早、近、平”來概括，即施用時間要早，一般用作基肥、種肥、苗肥；施肥與作物根系的距離要近；種苗肥料要混好。

4、 與有機肥同時施用，兩種肥料混合使用，可提高肥效。

5、施肥后立即覆土，避免陽光直射，殺滅微生物，降低生物肥料利用率..

6、不適宜與化肥、殺菌劑等農藥混合使用，會抑制生物肥料中微生物的生長，甚至殺死微生物，從而影響肥料的肥效。

7、防止與未熟農家肥混合，因為農家肥在成熟過程中會發(fā)酵，這樣會直接殺死生物菌。

8、不同種類的復合微生物菌肥不能混用。目前，市面上的生物肥料中含有多種細菌，其中含有不同的活性菌，它們之間是否存在相互抗性還不是很清楚，如果它們相互抗性，就會降低肥料效率。